魔法英雄的关卡玩法主要分为两种，一般战斗的MOBA类关卡以及塔防类两种游戏模式。一般战斗中玩家可以派出五名英雄角色进行闯关。一个关卡分成三场战斗，每打完一场就会往前「推进」至下一场战斗的位置，呈现出MOBA 游戏中「从我家打到对方家」的感觉。
【MOBA类关卡】
战斗流程采自动攻击，而当英雄头像下方的计量表满格时就可以手动施展技能。本作最大的特色就在于其采用了「指向性技能系统」，让玩家可以自行选择技能的攻击方向或位置。
由于敌方的队伍通常也是由坦克在前排阻挡、法师与射手在后排输出，因此藉由指向性技能破坏敌人的阵形、击破敌方后排的输出角色、或用控场技瘫痪敌方输出就是一个非常重要的策略。相反的，若敌人使用技能冲散我方的阵形，导致后排输出与辅助英雄受到威胁的话，用控场技打断敌人也能有效降低被害状况。
本作在设计上十分强调技能施放的策略，甚至说技能系统是战斗的核心也不为过。如果玩家在一场难度正常的战斗中全程袖手旁观的话，通常都会落得全灭的下场。
【塔防类关卡】
每当主线关卡达到一定进度时，便能解锁本作的另一特色－塔防关卡。塔防关卡采取了「英雄即是塔」的设计，原本在一般关卡中负责进攻的英雄们，到了塔防关卡则必须努力阻挡敌人入侵。由于英雄就是塔，因此塔的效果与技能也理所当然地参照了英雄本身的特性，像是坦克型的西利会派出士兵阻挡敌人前进、而支援型的奥拉则可以施放技能为士兵补血等等。
即使在塔防关卡也一样能发动技能，英雄每击杀一个敌方单位就会获得部分能量，当能量满时玩家可手动释放大招。
虽然塔防关卡的破关与否并不会影响主线关卡，但是塔防关卡在过关后会持续生产能让英雄升级的经验值药水，因此通过越多塔防关卡也意味着生产效率越高。